Histopathology data for Cad

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Thyroid
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Liver [MA:0000358] 1 0 Hepatic hemorrhage with erythrophagocytosis
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Thyroid
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Thyroid
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Thyroid
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter