Histopathology data for Taf12

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Thyroid
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Thyroid
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Thyroid
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter