Histopathology data for Znhit6

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #6 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #5 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #5 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #5 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 1 0 chronic
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Thyroid
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #6 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #5 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET M #6 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #5 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #6 Thymus [MA:0000142]
HET M #6 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #5 Small intestine [MA:0000337]
HET M #6 Heart [MA:0000072]
HET F #5 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #6 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #6 Stomach [MA:0000353]
HET M #6 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #5 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #6 Lung [MA:0000415]
HET M #6 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET F #5 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #6 Epididymis [MA:0000397]
HET F #5 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #5 Thyroid
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #6 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #5 Lymph node [MA:0000139] 1 0 chronic
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #6 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #6 Femur [MA:0001359]
HET M #6 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #5 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #5 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #5 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #5 Uterus [MA:0000389]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #6 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET F #5 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #6 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #6 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #6 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #6 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Thyroid
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #6 Testis [MA:0000411]
HET F #5 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET M #6 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #5 Heart [MA:0000072]
HET M #6 Bone [MA:0001459]
HET M #6 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET F #5 Ovary [MA:0000384]
HET F #5 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #6 Thyroid
HET F #5 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #6 Skin [MA:0000151]
HET F #5 Pancreas [MA:0000120]
HET M #6 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET M #6 Pancreas [MA:0000120]
HET M #6 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #5 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #5 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Thyroid
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #5 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #5 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET M #6 Knee joint [MA:0000471]
HET M #6 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Thyroid
HET M #6 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #5 Trachea [MA:0000441]
HET F #5 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #5 Knee joint [MA:0000471]
HET F #5 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #5 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #6 Spleen [MA:0000141]
HET F #5 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #5 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #5 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #5 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET F #5 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #5 Large intestine [MA:0000333]
HET M #6 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #6 Esophagus [MA:0000352]
HET M #6 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #5 Ear [MA:0000236]
HET M #6 Lymph node [MA:0000139] 1 0 chronic
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #6 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Heart [MA:0000072]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter