Histopathology data for Speer4f1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 1 0 Mild mucometra
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Thyroid
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Thyroid
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Liver [MA:0000358] 3 0 Portal vein hypoplasia, arteriolar reduplication and biliary hyperplasia (consistent with a portosystemic shunt)
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #2 Thyroid
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Thyroid
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Ear [MA:0000236]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter