Histopathology data for Smg5

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Lung [MA:0000415] 2 1 focally extensive Fatty (adipose tissue) infiltration
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Thyroid
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Thyroid
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Lung [MA:0000415] 1 1 focally extensive Fatty (adipose tissue) infiltration
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Thyroid
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]

Associated histopathology images

Smg5
heterozygote
Lung - MA term MA:0000415
Smg5em1(IMPC)Mbp
experimental
Smg5
heterozygote
Lung - MA term MA:0000415
Smg5em1(IMPC)Mbp
experimental

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter