Histopathology data for Smdt1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 1 0 multi-localised subacute Gastritis
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET M #2 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Thyroid 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET M #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0

Associated histopathology images

Smdt1
heterozygote
Stomach - MA term MA:0000353
Smdt1tm1b(EUCOMM)Wtsi
experimental

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter