Histopathology data for Slc9a3

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #3 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Thyroid 0 0
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #2 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Bone [MA:0001459] 0 0
HET M #4 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #3 Thyroid 0 0
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Thyroid 0 0
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #2 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #4 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080] 0 0
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #2 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #2 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #3 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #2 Subcutaneous adipose tissue 0 0
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Ovary [MA:0000384] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter