Histopathology data for Rsph9

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET M #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #2 Thyroid 0 0
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #2 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #2 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter