Histopathology data for Rab2a

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #1 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #3 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #2 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #1 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #2 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #1 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #4 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Thyroid 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Tibia [MA:0001361] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter