Histopathology data for Pnkp

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #1 Thyroid
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Liver [MA:0000358] 1 0 Liver: Mild, multifocal, mononuclear and neutrophilic cellular infiltrates
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 1 0 Peri-pancreatic adipose tissue: Mild, multifocal, lymphocytic cellular infiltrates
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 2 0 Salivary gland: Moderate, multifocal, mononuclear cellular infiltrate
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Liver [MA:0000358] 1 0 Liver: Minimal, focal, neutrophilic and mononuclear cellular infiltrate
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0 Brown adipose tissue: Mild, focal, mononuclear steatitis
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Thyroid
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 1 0 Kidney, unilateral: Mild, multifocal, mononuclear cellular infiltrate
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 1 0 Pancreas: Mild, lobular, acinar cell hypertrophy
HET F #4 Thyroid
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Eye [MA:0000261] 1 0 Eye, unilateral: Minimal multifocal retinal dysplasia
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Thyroid
HET M #1 Kidney [MA:0000368]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter