Histopathology data for Npc2

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #3 Thyroid 0 0
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #2 Liver [MA:0000358] 3 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 3 0
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 4 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #2 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #2 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #2 Lung [MA:0000415] 2 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #2 Brain [MA:0000168] 4 0
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 4 0
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #2 Thyroid 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 3 0
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 3 0
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter