banner
Genes Phenotypes Help, News, Blog

Histopathology data for Nifk

Home Genes Nifk Histopathology

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Thyroid
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 1 0 Peri-pancreatic adipose tissue: Mild, multifocal, mononuclear cellular infiltrate
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 1 0 Stomach, glandular: Mild, focal, glandular mineral with hyaline droplet accumulation
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Liver [MA:0000358] 1 0 Liver: Mild, focal, neutrophilic and mononuclear cellular infiltrate
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Liver [MA:0000358] 1 0 Liver: Mild, focal, neutrophilic and mononuclear cellular infiltrate
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 1 0 Stomach, glandular: Focal, mild, gland necrosis
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Thyroid
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Thyroid
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Thyroid
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, paracortical and follicular lymphoid hyperplasia
HET M #1 Testis [MA:0000411]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter