Histopathology data for Nhlh1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HOM F #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HOM F #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #5 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #4 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #5 Thyroid 0 0
HET M #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HOM F #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #5 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HOM F #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HOM F #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HOM F #3 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #5 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HOM F #3 Uterus [MA:0000389] 0 0
HOM F #3 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HOM F #3 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #5 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #5 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #5 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HOM F #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HOM F #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HOM F #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #5 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #5 Kidney [MA:0000368] 0 0
HOM F #3 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #5 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #5 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #5 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #5 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #5 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HOM F #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #5 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HOM F #3 Ovary [MA:0000384] 0 0
HOM F #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HOM F #3 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #5 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HOM F #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #5 Liver [MA:0000358] 0 0
HOM F #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #5 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #4 Thyroid 0 0
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HOM F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #5 Spleen [MA:0000141] 0 0
HOM F #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HOM F #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #5 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #5 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #5 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HOM F #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HOM F #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HOM F #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HOM F #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Testis [MA:0000411] 1 0 chronic distributed Testicular degeneration and atrophy with hypospermatogenesis.
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #2 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #5 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #5 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HOM F #3 Thyroid 0 0
HOM F #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HOM F #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #5 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #5 Thymus [MA:0000142] 0 0
HOM F #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #5 Eye [MA:0000261] 0 0
HOM F #3 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #5 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #5 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HOM F #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HOM F #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #5 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #5 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #5 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #5 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #5 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HOM F #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #5 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HOM F #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET M #2 Heart [MA:0000072] 2 0 localized chronic Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET F #5 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #1 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #5 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HOM F #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HOM F #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HOM F #3 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #2 Thyroid 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #5 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #2 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Sternum [MA:0001331] 3 0 chronic localized Sternal segment dislocation.
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0

Associated histopathology images

Nhlh1
heterozygote
Testis - MA term MA:0000411
Nhlh1tm1b(KOMP)Wtsi
experimental

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter