Histopathology data for Mmachc

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #2 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Thyroid 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #3 Thyroid 0 0
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #3 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #2 Thyroid 0 0
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #4 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #3 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #3 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #3 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #4 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #2 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter