Histopathology data for Lsm8

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Thyroid
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Thyroid
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Thyroid
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Thyroid
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter