Histopathology data for Kirrel1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Testis [MA:0000411] 0
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080] 0 0
HET F #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080] 0 0
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 1 0 Salivary gland: Mild mononuclear cell infiltrates
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0 Adipose tissue: Focal mild mononuclear cell infiltrates
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Ovary [MA:0000384] 0
HET M #4 Thyroid 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0
HET F #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #1 Thyroid 0 0
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145] 0
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0 Adipose tissue: Focal mild mononuclear cell infiltrates
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #3 Thyroid 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter