Histopathology data for Hyls1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #4 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Thyroid 0 0
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #1 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #3 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #3 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET F #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Stomach [MA:0000353] 2 0 multi-localised subacute Gastritis, suppurative.
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET M #4 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #4 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Thyroid 0 0
HET M #4 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #1 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #4 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #2 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #3 Thyroid 0 0
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #4 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #3 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 2 0 localized chronic Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Sternum [MA:0001331] 3 0 chronic localized Segmental sternum dislocation
HET M #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #4 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #3 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #3 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #3 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #1 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET M #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #3 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #1 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0

Associated histopathology images

Hyls1
heterozygote
Stomach - MA term MA:0000353
Hyls1em1(IMPC)Tcp
experimental
Hyls1
heterozygote
Hyls1em1(IMPC)Tcp
experimental

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter