Histopathology data for Gps1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 3 0 localized chronic Sternal segment dislocation
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 1 0 chronic multi-localised Multiocal retinal dysplasia.
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 2 0 chronic localized Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #4 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Thyroid 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter