Histopathology data for Gnptab

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #2 Thyroid
HET M #6 Skin [MA:0000151]
HET F #7 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #6 Ear [MA:0000236]
HET F #5 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #6 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #5 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #8 Pancreas [MA:0000120]
HET F #5 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #6 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #8 Bone [MA:0001459]
HET F #5 Lymph node [MA:0000139]
HET F #8 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #7 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #8 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #5 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #6 Large intestine [MA:0000333]
HET F #8 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #7 Femur [MA:0001359]
HET F #7 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346] 1 0 focally extensive Parotid atrophy
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Bone [MA:0001459] 1 0 chronic osteoarthropathy in the atlanto-occipital joint
HET F #5 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #5 Tongue [MA:0000347]
HET F #5 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #6 Knee joint [MA:0000471] 2 0 chronic osteoarthropathy with cartilage degeneration and tendon chondroid metaplasia
HET F #5 Brain [MA:0000168]
HET F #8 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #6 Thyroid
HET F #5 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #7 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #7 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #5 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #8 Ovary [MA:0000384]
HET F #7 Small intestine [MA:0000337]
HET M #6 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #7 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #7 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #6 Femur [MA:0001359]
HET M #6 Eye [MA:0000261]
HET F #7 Tibia [MA:0001361]
HET M #6 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #5 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET M #6 Tooth [MA:0000348]
HET F #8 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #7 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #5 Ovary [MA:0000384]
HET F #7 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #8 Large intestine [MA:0000333]
HET F #8 Stomach [MA:0000353]
HET M #6 Tibia [MA:0001361]
HET F #8 Spleen [MA:0000141]
HET M #6 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #6 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Heart [MA:0000072] 1 0 left ventricular hypertrophy
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #5 Large intestine [MA:0000333]
HET F #7 Bone [MA:0001459]
HET F #7 Uterus [MA:0000389] 1 0 cystic endometrial hyperplasia
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #8 Uterus [MA:0000389]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #8 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #7 Esophagus [MA:0000352]
HET F #8 Lung [MA:0000415]
HET F #7 Thyroid
HET F #7 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #7 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET F #5 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET F #8 Eye [MA:0000261]
HET F #8 Lymph node [MA:0000139]
HET F #5 Thymus [MA:0000142]
HET F #5 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET M #6 Kidney [MA:0000368] 1 0 chronic glomerulonephropathy with tubular degeneration
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #6 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #5 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #5 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 1 0 intersternabrae degenerative disc disease
HET M #6 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 1 0 chronic glomerulonephropathy with tubular degeneration
HET F #5 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #5 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #5 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #7 Heart [MA:0000072] 1 0 left ventricular hypertrophy with arteriosclerosis
HET F #8 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #7 Liver [MA:0000358]
HET F #8 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Thyroid
HET M #6 Testis [MA:0000411]
HET F #5 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Bone [MA:0001459] 1 0 chronic osteoarthrosis in TMJ and atlanto-occipital joint
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #8 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #6 Brain [MA:0000168]
HET F #5 Bone [MA:0001459]
HET M #6 Heart [MA:0000072] 1 0 cardiomyopathy with multifocal fibrosis, arteriolosclerosis and endocardiosis
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #5 Knee joint [MA:0000471]
HET M #6 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #6 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #5 Thyroid
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #6 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #8 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #6 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #8 Tibia [MA:0001361]
HET F #8 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #6 Lymph node [MA:0000139]
HET F #7 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #8 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #8 Small intestine [MA:0000337]
HET F #7 Ovary [MA:0000384] 1 0 unilateral ovarian cyst
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #7 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #7 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET F #8 Trachea [MA:0000441]
HET M #6 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #5 Uterus [MA:0000389]
HET F #8 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #5 Ear [MA:0000236]
HET F #8 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #6 Epididymis [MA:0000397]
HET M #6 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #8 Esophagus [MA:0000352]
HET F #5 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET F #7 Spleen [MA:0000141]
HET M #6 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #7 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Thyroid
HET F #7 Kidney [MA:0000368] 1 0 chronic glomerulonephropathy with tubular degeneration
HET F #8 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #6 Sternum [MA:0001331] 1 0 intersternabrae degenerative disc disease
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #7 Tongue [MA:0000347]
HET F #5 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #6 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #7 Trachea [MA:0000441]
HET F #7 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #7 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET M #6 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #5 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET F #5 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #8 Kidney [MA:0000368]
HET F #8 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Kidney [MA:0000368] 1 0 chronic glomerulonephropathy
HET F #8 Heart [MA:0000072]
HET F #5 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #7 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #8 Tongue [MA:0000347]
HET F #7 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Stomach [MA:0000353] 2 0 Mucous cell hyperplasia with chief/parietal cell loss, hyalinosis and gastritis at the limiting ridge
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #6 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #8 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #8 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #7 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #5 Liver [MA:0000358]
HET F #8 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #6 Bone [MA:0001459]
HET F #5 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #7 Stomach [MA:0000353]
HET M #6 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #7 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #5 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #5 Pancreas [MA:0000120]
HET F #8 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #7 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #6 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Thyroid
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #7 Knee joint [MA:0000471]
HET F #5 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #5 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET F #7 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #6 Esophagus [MA:0000352]
HET M #6 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #6 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #8 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #8 Thyroid

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter