Histopathology data for Fmc1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #1 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #4 Thyroid 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Thyroid 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter