Histopathology data for Fgfr1op2

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Subcutaneous adipose tissue
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #1 White adipose tissue [MA:0000058]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Pituitary gland [MA:0000176]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #1 Pituitary gland [MA:0000176]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471] 3 0 Knee: Marked, periarticular spindle cell proliferation (fibroplasia and fibrosis)
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097]
HET M #3 Pituitary gland [MA:0000176]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Thyroid
HET M #4 Pituitary gland [MA:0000176]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 White adipose tissue [MA:0000058]
HET M #3 Thyroid
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 White adipose tissue [MA:0000058]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Subcutaneous adipose tissue
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Subcutaneous adipose tissue
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Thyroid
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 White adipose tissue [MA:0000058]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Subcutaneous adipose tissue
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Thyroid
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter