Histopathology data for Cwc22

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #5 Stomach [MA:0000353]
HET M #5 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #7 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Thyroid
HET F #8 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #6 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #6 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #7 Liver [MA:0000358]
HET F #8 Liver [MA:0000358] 1 0 Liver: Multilocular biliary cyst
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #5 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #6 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, lymphofollicular hyperplasia
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #6 Skin [MA:0000151]
HET M #5 Eye [MA:0000261]
HET F #6 Ovary [MA:0000384]
HET F #6 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #7 Heart [MA:0000072]
HET F #6 Uterus [MA:0000389] 1 0 Uterus: Mild, bilateral, cystic endometrial hyperplasia
HET F #7 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #6 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #8 Stomach [MA:0000353]
HET M #5 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #5 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #5 Skin [MA:0000151]
HET F #7 Uterus [MA:0000389]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Heart [MA:0000072] 1 0 mild ventricular hypertrophy with cardiomyocyte disarray and karyomegaly
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #7 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #8 Thyroid
HET F #7 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #6 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET F #8 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #6 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #7 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #7 Thyroid
HET F #7 Thymus [MA:0000142]
HET M #5 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #7 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #6 Knee joint [MA:0000471]
HET F #6 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, peripancreatic: Mild, lymphoid hyperplasia; Lymph node, mesenteric: Mild, lymphofollicular hyperplasia
HET M #5 Ear [MA:0000236]
HET F #7 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #8 Esophagus [MA:0000352]
HET F #7 Kidney [MA:0000368]
HET F #8 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #7 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #8 Heart [MA:0000072]
HET F #8 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #7 Sternum [MA:0001331]
HET F #7 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #6 Large intestine [MA:0000333]
HET F #6 Eye [MA:0000261]
HET F #7 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #5 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #8 Ovary [MA:0000384]
HET F #6 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #6 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #6 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #8 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #8 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Thyroid
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #5 Kidney [MA:0000368]
HET M #5 Thymus [MA:0000142]
HET M #5 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #6 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Thyroid
HET M #5 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #6 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET F #8 Lung [MA:0000415]
HET F #8 Small intestine [MA:0000337]
HET F #7 Tibia [MA:0001361]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #8 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #6 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0 Mesenteric adipose tissue: Presumptive sarcoma
HET M #5 Tibia [MA:0001361]
HET F #8 Uterus [MA:0000389] 1 0 Uterus: Mild, bilateral cystic endometrial hyperplasia
HET F #8 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #6 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #6 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET F #8 Salivary gland [MA:0000346] 2 0 Salivary gland: Moderate, multifocal mononuclear cellular infiltrate
HET M #5 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #8 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Thyroid
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #8 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET F #7 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #8 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #7 Stomach [MA:0000353]
HET M #5 Sternum [MA:0001331]
HET F #7 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #8 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #7 Pancreas [MA:0000120]
HET F #8 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #5 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #8 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #7 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #6 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #5 Pancreas [MA:0000120]
HET M #5 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #8 Tooth [MA:0000348]
HET M #5 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #8 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #7 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #5 Tooth [MA:0000348]
HET F #6 Small intestine [MA:0000337]
HET M #5 Epididymis [MA:0000397]
HET M #5 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #8 Tongue [MA:0000347]
HET F #6 Kidney [MA:0000368]
HET F #6 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #7 Large intestine [MA:0000333]
HET F #6 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #8 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #5 Large intestine [MA:0000333]
HET F #7 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #6 Trachea [MA:0000441]
HET F #7 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #7 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #5 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #8 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET F #7 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #6 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #5 Femur [MA:0001359]
HET F #7 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET F #8 Sternum [MA:0001331]
HET F #6 Thyroid
HET F #7 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #6 Bone [MA:0001459]
HET M #5 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #8 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #8 Lymph node [MA:0000139]
HET F #6 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #5 Knee joint [MA:0000471]
HET M #5 Trachea [MA:0000441]
HET F #7 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #5 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #5 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET F #6 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #8 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET F #8 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 1 0 Spleen: Mild, lymphofollicular hyperplasia with mild, extramedullary hematopoiesis
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #7 Ear [MA:0000236]
HET F #8 Knee joint [MA:0000471]
HET F #8 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #6 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #6 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET F #7 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 1 0 Salivary gland: Mild, multifocal mononuclear cellular infiltrate
HET F #7 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 2 0 Seminal vesicle: Moderate, bilateral dilation with epithelial attenuation
HET M #5 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 1 0 Spleen: Mild, extramedullary hematopoiesis
HET M #5 Testis [MA:0000411]
HET M #5 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #6 Tooth [MA:0000348]
HET M #5 Thyroid
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #8 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #6 Femur [MA:0001359]
HET F #6 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #8 Brain [MA:0000168]
HET F #7 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET M #5 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Lung [MA:0000415] 1 0 Lung: Adenoma
HET F #6 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #5 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #7 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #8 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #5 Esophagus [MA:0000352]
HET F #7 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #5 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter