Histopathology data for Cox6b1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 1 0 chronic localized Granulation tissue, mammary gland
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #2 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #1 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #1 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 1 0 localized chronic nflammation and repair, skeletal muscle.
HET M #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #4 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #1 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 1 0 localized chronic nflammation and repair, skeletal muscle.
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #1 Thyroid 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0

Associated histopathology images

Cox6b1
heterozygote
Mammary gland - MA term MA:0000145
Cox6b1em1(IMPC)Tcp
experimental
Cox6b1
heterozygote
Skeletal muscle - MA term MA:0003148
Cox6b1em1(IMPC)Tcp
experimental
Cox6b1
heterozygote
Skeletal muscle - MA term MA:0003148
Cox6b1em1(IMPC)Tcp
experimental

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter