Histopathology data for Cecr2

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #3 Thyroid 0 0
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #4 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] Not applicable 0 chronic multi-localised Lymphoma.
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Thyroid 0 0
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #3 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Thyroid 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #3 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #4 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #2 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #3 Eye [MA:0000261] 1 0 chronic multi-localised multifocal retinal dysplasia.
HET M #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #3 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #3 Femur [MA:0001359] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter