Histopathology data for Brd9

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #7 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #7 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #8 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #8 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #6 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #7 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 2 0 multi-localised chronic Multifocal lymphoid aggregates, lung
HET F #2 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET F #7 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #6 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #3 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #7 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #5 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #7 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #6 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #8 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #7 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #8 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET M #8 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #6 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #6 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #6 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #3 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #7 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #6 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #8 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #8 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 3 0 localized chronic Sternal segment dislocation.
HET M #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #8 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #5 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #4 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #7 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #1 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #6 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #5 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 3 0 chronic multi-localised Steatosis and multifocal lymphoid aggregates, liver
HET F #7 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #8 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #7 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #6 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #6 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET M #8 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #6 Kidney [MA:0000368] 0 1 0 0 chronic localized Lymphoid aggregates, renal pelvis
HET M #5 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #7 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #6 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #5 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #6 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #7 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #8 Lymph node [MA:0000139] Not applicable 0 distributed chronic Lymphoma
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #5 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #5 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #8 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #7 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET M #6 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #8 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #5 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #5 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #8 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #8 Thyroid 0 0
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #5 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #6 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #5 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #3 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #5 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #5 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #8 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET M #6 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Thyroid 0 0
HET M #5 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #8 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #5 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #5 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #8 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #6 Salivary gland [MA:0000346] 2 0 chronic multi-localised Lymphoid aggregations, salivary gland
HET M #4 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #5 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #5 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #4 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #3 Thyroid 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #5 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #7 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #6 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #3 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #5 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #7 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #7 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #6 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #8 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #7 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 2 0 multi-localised chronic Lymphoid aggregations, salivary gland
HET F #3 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #8 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 2 0 chronic multi-localised Lymphoid aggregations, salivary gland
HET F #7 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET M #5 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #6 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #6 Sternum [MA:0001331] 3 0 chronic localized Sternal segment dislocation.
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #7 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #5 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #7 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #6 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #4 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #6 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #7 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #5 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #5 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #7 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #5 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #7 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #7 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #8 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #6 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 3 0 chronic multi-localised Steatosis and multifocal lymphoid aggregates, liver
HET M #8 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #6 Thyroid 0 0
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #6 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #6 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #7 Thyroid 0 0
HET M #8 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #6 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #6 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #6 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #7 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #8 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #6 White adipose tissue [MA:0000058] 3 0 multi-localised chronic Lymphoid aggregates, white adipose tissue, around urethra
HET F #3 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #3 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #2 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 1 0 localized chronic Lymphoid aggregates, renal pelvis
HET M #5 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #7 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #6 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #7 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #6 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #8 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #5 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #7 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #8 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #7 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #7 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #4 Liver [MA:0000358] 3 0 chronic multi-localised Steatosis and multifocal lymphoid aggregates, liver
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #5 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #7 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #8 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #6 Liver [MA:0000358] 3 0 chronic multi-localised Steatosis and multifocal lymphoid aggregates, liver
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #5 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #8 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057] 3 0 chronic localized Lymphoid aggregates, brown adipose tissue
HET F #7 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #5 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #5 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #7 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #8 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #7 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #8 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #7 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #7 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #7 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #8 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #8 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #6 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #2 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #5 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #5 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #6 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #8 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #6 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #8 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #7 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #3 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET M #8 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #8 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET M #8 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #8 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #5 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #8 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #5 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #4 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #8 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #6 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 2 0 multi-localised chronic Lymphoid aggregations, salivary gland
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #6 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #5 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #5 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #8 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #5 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #6 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #6 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #6 Lung [MA:0000415] 2 0 multi-localised chronic Multifocal lymphoid aggregates, lung
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #8 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #8 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #6 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #5 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #7 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #8 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #7 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #6 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #7 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #7 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #5 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #5 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #5 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Femur [MA:0001359] 1 0 chronic Osteopenia and osteoarthritis, femur
HET M #5 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #5 Thyroid 0 0
HET F #1 White adipose tissue [MA:0000058] 3 0 chronic multi-localised Lymphoid aggregates, white adipose tissue, around urethra
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0

Associated histopathology images

Brd9
heterozygote
Lung - MA term MA:0000415
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Femur - MA term MA:0001359
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Salivary gland - MA term MA:0000346
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Brown adipose tissue - MA term MA:0000057
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Liver - MA term MA:0000358
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Liver - MA term MA:0000358
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Kidney - MA term MA:0000368
Kidney - MA term MA:0000368
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Lung - MA term MA:0000415
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Liver - MA term MA:0000358
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
White adipose tissue - MA term MA:0000058
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Salivary gland - MA term MA:0000346
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Salivary gland - MA term MA:0000346
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Liver - MA term MA:0000358
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
White adipose tissue - MA term MA:0000058
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Kidney - MA term MA:0000368
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental
Brd9
heterozygote
Salivary gland - MA term MA:0000346
Brd9em1(IMPC)Tcp
experimental

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter