Histopathology data for Bckdha

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #1 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #3 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET M #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #4 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #2 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET F #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Sternum [MA:0001331] 3 0 localized chronic Segmental sternum dislocation
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Thyroid 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #4 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Tibia [MA:0001361] 0 0
HET F #2 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #1 Knee joint [MA:0000471] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 White adipose tissue [MA:0000058] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #2 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #1 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057] 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #3 Pituitary gland [MA:0000176] 0 0
HET M #1 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter