Histopathology data for Bbs1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Thyroid
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Thyroid
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Thyroid
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Thyroid
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter