Histopathology data for Aff4

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Thyroid
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Thyroid
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Thyroid
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Thyroid
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter