Histopathology data for Satb2

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #5 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #8 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #8 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #5 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #3 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #6 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #8 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #6 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #5 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #5 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Thyroid 0 0
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 1 1 0 0 distributed multi-localised Inflammatory cell aggregates Hepatocellular vacuolar change (midzonal and pericentral)
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #7 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #7 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #6 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #7 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #6 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #6 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #8 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #8 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #8 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #7 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #6 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #5 Thyroid 0 0
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #7 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #7 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #7 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #7 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #5 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #7 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #5 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #8 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #5 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #6 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #8 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #5 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #5 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #8 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #6 Liver [MA:0000358] 1 1 0 0 0 0 distributed Hepatocellular vacuolar change (midzonal and pericentral) Extramedullary hematopoesis
HET F #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #6 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 1 0 0 0 localized Lymphoid hyperplasia with histiocytosis
HET F #6 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #8 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #8 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #5 Lymph node [MA:0000139] 0 Not applicable 0 0 distributed chronic Lymphoma; early
HET M #7 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #7 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #6 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #5 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #5 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #7 Thyroid 0 0
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #7 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #7 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #5 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #5 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #6 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #8 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #6 Lymph node [MA:0000139] 0 1 0 0 localized Lymphoid hyperplasia with histiocytosis
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #5 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #6 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #6 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #6 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #7 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #6 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #7 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #8 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #8 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #5 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #3 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #6 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #8 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 0 3 0 0 chronic localized Sternal segment dislocation
HET F #6 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Thyroid 0 0
HET F #5 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #8 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #7 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #7 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #8 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 4 0 focally extensive chronic-active Sternal dislocation with fibroplasia
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #2 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #6 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #5 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #5 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #6 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #5 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #6 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #6 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #8 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #6 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #7 Heart [MA:0000072] 3 0 focally extensive chronic Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET F #6 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #7 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #8 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #5 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #7 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Liver [MA:0000358] 0 1 1 0 0 0 distributed Hepatocellular vacuolar change (midzonal and pericentral) Extramedullary hematopoesis
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #7 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #8 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #4 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #6 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #6 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #8 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #8 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #8 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #6 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #7 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #7 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #8 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #7 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #3 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #6 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #6 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #5 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #6 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #5 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #4 Testis [MA:0000411] 1 0 random pattern seminiferous tubules with multinucleated spermatid Giant cells
HET M #8 Thyroid 0 0
HET M #2 Brain [MA:0000168] 1 0 0 0 bilateral acute Bilateral hydrocephalus, mild.
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #8 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #5 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 1 0 localized Lymphoid hyperplasia with histiocytosis
HET F #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #6 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #8 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #7 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #7 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #5 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #8 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #5 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #5 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #8 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #8 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #7 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #6 Thyroid 0 0
HET F #6 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #6 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #7 Sternum [MA:0001331] Not applicable 0 focally extensive chronic Sternal dislocation with reparative chondroid hyperplasia ('calus')
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #6 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #6 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #5 Liver [MA:0000358] 0 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #7 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #5 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #7 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #5 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #8 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #8 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #5 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #8 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #7 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #5 Stomach [MA:0000353] 0 2 0 0 subacute multi-localised Gastritis, suppurative.
HET F #6 Brain [MA:0000168] 1 0 0 0 bilateral acute Bilateral hydrocephalus, mild.
HET M #8 Testis [MA:0000411] 1 0 random pattern seminiferous tubules with multinucleated spermatid Giant cells
HET M #8 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #3 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #7 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET M #2 Heart [MA:0000072] 1 0 0 0 localized epicardial fibrosis
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #6 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #7 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #7 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #8 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #2 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #8 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Sternum [MA:0001331] 2 0 chronic focally extensive Sternal dislocation with reparative chondroid hyperplasia ('calus')
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #7 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #5 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #5 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #7 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #8 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #8 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #5 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #7 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #7 Liver [MA:0000358] 1 1 0 0 multi-localised distributed Inflammatory cell aggregates Hepatocellular vacuolar change (midzonal and pericentral)
HET M #4 Thyroid 0 0
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0

Associated histopathology images

Satb2
heterozygote
Testis - MA term MA:0000411
Satb2em3(IMPC)Tcp
experimental
Satb2
heterozygote
Stomach - MA term MA:0000353
Stomach - MA term MA:0000353
Satb2em3(IMPC)Tcp
experimental
Satb2
heterozygote
Testis - MA term MA:0000411
Satb2em3(IMPC)Tcp
experimental

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter