Histopathology data for Got2

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Thyroid
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Thyroid
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Thyroid
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter