Histopathology data for Xdh

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Subcutaneous adipose tissue
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 1 0 Gallbladder: Mild, neutrophilic submucosal infiltrate
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Thyroid
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Pituitary gland [MA:0000176]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 1 0 Spleen: Extramedullary hematopoiesis, mild increase
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Pituitary gland [MA:0000176]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Thyroid
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Subcutaneous adipose tissue
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 1 0 Spleen: Extramedullary hematopoiesis, mild increase
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Ear [MA:0000236] 1 0 Middle ear, unilateral: Mild, locally extensive, neutrophilic otitis media
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 2 0 Uterine horns, bilateral: Moderate, pyometra with mild luminal eosinophilic crystals
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 White adipose tissue [MA:0000058]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Thyroid
HET F #1 Eye [MA:0000261] 1 0 Eye, unilateral: Mild, focal, retinal dysplasia
HET F #3 White adipose tissue [MA:0000058]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #1 White adipose tissue [MA:0000058]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Pituitary gland [MA:0000176]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Thyroid
HET F #3 Optic II nerve [MA:0001097]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Subcutaneous adipose tissue
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Subcutaneous adipose tissue
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #1 Pituitary gland [MA:0000176]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 White adipose tissue [MA:0000058]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Bone [MA:0001459]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter