Histopathology data for Tctn1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Brain [MA:0000168] 1 0 Mild hydrocephalus
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0 Minimal to mild focal chronic non-suppurative steatitis
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Brain [MA:0000168] 1 0 Mild hydrocephalus
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0 mild multifocal chronic non-suppurative steatitis
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Thyroid
HET F #2 Thyroid
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Brain [MA:0000168] 1 0 Mild hydrocephalus
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Thyroid
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0 Mild to minimal multifocal chronic non-suppurative steatitis
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET F #2 Ear [MA:0000236]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter