Histopathology data for Supt4a

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #2 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #2 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 3 0 localized chronic Sternal segment dislocation
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #2 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 2 0 chronic localized Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 3 0 localized chronic Sternal segment dislocation
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #2 Thyroid 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter