Histopathology data for Smg6

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #7 Knee joint [MA:0000471]
HET M #6 Epididymis [MA:0000397]
HET F #7 Ovary [MA:0000384]
HET M #6 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Thyroid
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET F #7 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #6 Pancreas [MA:0000120]
HET F #5 Thyroid
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #7 Lymph node [MA:0000139]
HET F #5 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #7 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET M #6 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #6 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #5 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #5 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #6 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Thyroid
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #7 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #5 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #5 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #7 Tongue [MA:0000347]
HET F #7 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET M #6 Testis [MA:0000411]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #7 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #7 Large intestine [MA:0000333]
HET M #6 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0 focally extensive Focally extensive histiocytic steatitis
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #7 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #6 Tooth [MA:0000348]
HET F #7 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #5 Eye [MA:0000261]
HET F #5 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #6 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #7 Brain [MA:0000168]
HET M #6 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #5 Skin [MA:0000151] 2 0 Diffuse acanthosis with dysplasia, parakeratosis and minimal pustular dermatitis
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #5 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #7 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #6 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #7 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET F #5 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Thyroid
HET F #7 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #5 Femur [MA:0001359]
HET F #5 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Brain [MA:0000168] 2 0 Hydrocephalus
HET M #6 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #5 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET F #5 Lymph node [MA:0000139] 2 0 Mild lymphofollicular hyperplasia with medullary plasmacytosis
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #7 Tooth [MA:0000348]
HET F #5 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #5 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #5 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #6 Skin [MA:0000151]
HET M #6 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #7 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET F #5 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #6 Thyroid
HET M #6 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 1 0 uterine cystic endometrial hyperplasia
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #7 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #6 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #6 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #6 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #5 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #5 Tongue [MA:0000347]
HET M #6 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #6 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #5 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #7 Trachea [MA:0000441]
HET F #5 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #7 Bone [MA:0001459]
HET M #6 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #5 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #7 Thyroid
HET M #6 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #6 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #7 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #6 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #7 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #7 Kidney [MA:0000368]
HET F #5 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #7 Spleen [MA:0000141]
HET F #7 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #5 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #6 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #7 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #5 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #7 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #7 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET M #6 Stomach [MA:0000353]
HET F #5 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #7 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET M #6 Sternum [MA:0001331]
HET M #6 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET F #5 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #7 Esophagus [MA:0000352]
HET F #5 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #7 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET F #5 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #5 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #5 Ear [MA:0000236]
HET M #6 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #6 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Thyroid
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET F #7 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #6 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET M #6 Small intestine [MA:0000337]
HET F #5 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #5 Spleen [MA:0000141]
HET F #7 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #7 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #6 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET M #6 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #7 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET F #5 Pancreas [MA:0000120]
HET F #5 Kidney [MA:0000368]
HET M #6 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET F #5 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET M #6 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #5 Thymus [MA:0000142]
HET M #6 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Brain [MA:0000168] 1 0 Mild hydrocephalus
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #7 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #6 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter