Histopathology data for Pign

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Thyroid
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Thyroid
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Thyroid
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Thyroid
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter