banner
Genes Phenotypes Help, News, Blog

Histopathology data for Pcnt

Home Genes Pcnt Histopathology

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Pituitary gland [MA:0000176]
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 1 0 Spleen: Extramedullary hematopoiesis, mild increase
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 1 0 Spleen: Extramedullary hematopoiesis, mild increase
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 White adipose tissue [MA:0000058]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 1 0 Epididymis: Mild to moderate, multifocal, luminal cellular debris
HET F #2 Subcutaneous adipose tissue
HET M #1 Skin [MA:0000151] 1 0 Haired skin: Minimal to mild, multifocal, neutrophilic superficial dermatitis with mild acanthosis and mild serocellular crust
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Thyroid
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #3 Skin [MA:0000151] 1 0 Haired skin: Mild, multifocal, superficial dermal fibrosis
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 White adipose tissue [MA:0000058]
HET F #2 Thyroid
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #3 Subcutaneous adipose tissue
HET M #3 Eye [MA:0000261] 1 0 Eye, unilateral: Mild, focal, retinal dysplasia
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 1 0 Adrenal gland, unilateral: Mild, focal, cortical nodular hyperplasia
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, paracortical lymphoid hyperplasia
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097]
HET M #3 Thyroid
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Pituitary gland [MA:0000176]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 2 0 Spleen: Extramedullary hematopoiesis, moderate increase
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Subcutaneous adipose tissue
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Subcutaneous adipose tissue
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Testis [MA:0000411] 1 0 Testis: Mild, multifocal, germ cell degeneration with mild increased multinucleated cells
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, paracortical lymphoid hyperplasia
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 1 0 Gallbladder: Mild, neutrophilic, submucosal infiltrate
HET M #1 Thyroid
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 White adipose tissue [MA:0000058]
HET M #1 Pituitary gland [MA:0000176]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Pituitary gland [MA:0000176]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 White adipose tissue [MA:0000058]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, paracortical lymphoid hyperplasia
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter