Histopathology data for Nog

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284] 3 1 Nasal turbinate asymmetry
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Thyroid
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Thyroid
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284] 2 1 Nasal turbinate asymmetry
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Thyroid
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Thyroid
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284] 2 1 Nasal turbinate asymmetry
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284] 2 1 Nasal turbinate asymmetry
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]

Associated histopathology images

Nog
heterozygote
Nasal cavity - MA term MA:0000284
Nogem1(IMPC)Mbp
experimental
Nog
heterozygote
Nasal cavity - MA term MA:0000284
Nogem1(IMPC)Mbp
experimental
Nog
heterozygote
Nasal cavity - MA term MA:0000284
Nogem1(IMPC)Mbp
experimental

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter