Histopathology data for Nmnat2

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Thyroid
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Thyroid
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Thyroid
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Thyroid
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter