Histopathology data for Ncor2

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Thyroid 1 0 Thyroid gland: Mild, multifocal intracolloidal cellular infiltrate
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, follicular and paracortical lymphoid hyperplasia
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Thyroid
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Eye [MA:0000261] 1 0 Eye, Mild, retinal dysplasia
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Thyroid
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, paracortical lymphoid hyperplasia with mild, multifocal germinal center lymphocytolysis
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Thyroid
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 1 0 Duodenum: Focal, glandular ectasia and necrosis
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 2 0 Lymph node, submandibular: Moderate, lymphoid hyperplasia
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter