Histopathology data for Mycbp2

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 2 0 bilateral bilateral multifocal retinal disorganization (consistent with retinal dysplasia)
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Eye [MA:0000261] 1 0 Mild multifocal retinal dysplasia
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Thyroid
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Thyroid
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 2 0 Neutrophilic gastritis at the limiting ridge
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Thyroid
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Liver [MA:0000358] 2 0 Portal vein hypoplasia with arteriolar reduplication (consistent with a portosystemic shunt)
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Thyroid
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter