Histopathology data for Vps13d

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #1 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #1 Thyroid 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 1 0 Tubular hyperplasia (regenerative)
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #1 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #1 Thymus [MA:0000142] Not applicable 0 Thymic congenital cyst
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter