banner
Genes Phenotypes Help, News, Blog

Histopathology data for Vangl2

Home Genes Vangl2 Histopathology

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Liver [MA:0000358] 1 0 Liver: Minimal, focal, neutrophilic and mononuclear cellular infiltrate
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Eye [MA:0000261] 1 0 Eyes, bilateral: Mild to moderate, multifocal, retinal dysplasia
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Thyroid
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Thyroid
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, paracortical lymphoid hyperplasia
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Thyroid
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Lung [MA:0000415] 1 0 Lung: Mild, regionally extensive, eosinophilic crystalline pneumonia
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 1 0 Thymus: Mild, focal cyst with luminal macrophages
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Lung [MA:0000415] 3 0 Lungs: Severe, multifocal to coalescing, eosinophilic crystalline pneumonia
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 1 0 Peri-pancreatic adipose tissue: Mild, multifocal, mononuclear cellular infiltrates
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Thyroid
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 1 0 Spleen: Mild, multifocal, pigment accumulation (presumed melanin)
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Bone [MA:0001459]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter