Histopathology data for Atp6v1d

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #4 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #4 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #1 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #1 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 2 1 multifocal to coalescing Lymphoid hyperplasia
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #4 Thyroid 0 0
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Ear [MA:0000236] 0 0
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #4 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284] 0 0
HET M #4 Lung [MA:0000415] Not applicable 0 Ectopic liver tissue in the lung
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #3 Tooth [MA:0000348] 0 0
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 2 1 multifocal to coalescing Lymphoid hyperplasia
HET M #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Ear [MA:0000236] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter