Histopathology data for Lox

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Thyroid
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Thyroid
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Thyroid
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #4 Thyroid

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter