Histopathology data for Jun

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET M #3 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #3 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Thyroid
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Testis [MA:0000411]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Thyroid
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Thyroid
HET M #3 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Uterus [MA:0000389]
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET M #3 Thyroid
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter