Histopathology data for Itpr1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #2 Thyroid 0 0
HET F #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET F #4 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #1 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #4 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #3 Sternum [MA:0001331] 3 0 localized chronic Sternal segment dislocation
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #3 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #3 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #1 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #1 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #1 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #1 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #3 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET M #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #4 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET M #2 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET M #2 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #1 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #2 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #4 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #4 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #3 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #4 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET M #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #1 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET F #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #3 Thyroid 0 0
HET M #2 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET M #2 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #4 Thyroid 0 0
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #1 Thyroid 0 0
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #2 Tongue [MA:0000347] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter