Histopathology data for Gabrg2

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Thyroid
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057] 2 0 Adipose tissue, peri-salivary gland: Moderate, acute hemorrhage
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #4 Liver [MA:0000358] 1 0 Liver: Minimal, focal, mixed inflammatory hepatitis
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, paracortical and follicular lymphoid hyperplasia
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Testis [MA:0000411]
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346] 1 0 Salivary gland: Mild, focal mononuclear cellular infiltrates
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #4 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #4 Spleen [MA:0000141] 2 0 Spleen: Extramedullary hematopoiesis, moderate increase
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Uterus [MA:0000389] 1 0 Uterus: Mild, stromal edema
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Thyroid
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #4 Thyroid
HET F #4 Eye [MA:0000261] 1 0 Eye, bilateral: Mild, retinal dysplasia
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Eye [MA:0000261] 1 0 Eye, unilateral: Minimal, focal retinal dysplasia
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139] 1 0 Lymph node, mesenteric: Mild, paracortical and follicular lymphoid hyperplasia
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET M #1 Thyroid
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057] 1 0 Adipose tissue: Mild, multifocal mixed inflammatory steatitis
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Stomach [MA:0000353] 1 0 Stomach, glandular: Mild, focal, hyaline droplet accumulation with eosinophilic crystals
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter