Histopathology data for Ebf1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #8 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #7 Brain [MA:0000168] 1 0 bilateral hydrocephalus
HET M #5 Brain [MA:0000168] 1 0 bilateral hydrocephalus
HET M #5 Heart [MA:0000072] 1 0 Cardiomyopathy with arteriosclerosis and endocardiosis
HET F #7 Heart [MA:0000072] 1 0 Cardiomyopathy with arteriosclerosis and endocardiosis
HET M #6 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #7 Lung [MA:0000415]
HET M #5 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Femur [MA:0001359]
HET M #6 Brain [MA:0000168]
HET F #8 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #5 Stomach [MA:0000353]
HET M #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #7 Esophagus [MA:0000352]
HET M #6 Tibia [MA:0001361]
HET M #2 Bone [MA:0001459]
HET F #7 Tongue [MA:0000347]
HET M #5 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #5 Sternum [MA:0001331] 2 1 chronic Intersternebrae disc degeneration
HET F #7 Sternum [MA:0001331] 1 1 Intersternabrae and intervertebral degenerative disc disease
HET M #2 Tooth [MA:0000348]
HET M #5 Esophagus [MA:0000352]
HET M #2 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #6 Liver [MA:0000358]
HET F #4 Ovary [MA:0000384]
HET M #5 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #7 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #8 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #7 Stomach [MA:0000353] 1 0 focally extensive Gastritis and epithelial hyalinosis at the limiting ridge
HET F #7 Trachea [MA:0000441]
HET M #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Liver [MA:0000358]
HET M #6 Skin [MA:0000151]
HET F #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #8 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #8 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #4 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #6 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Trachea [MA:0000441]
HET F #7 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #6 Stomach [MA:0000353]
HET M #5 Trachea [MA:0000441]
HET F #8 Esophagus [MA:0000352]
HET M #3 Liver [MA:0000358] 1 0 Centrilobular lipidosis and glycogenosis with minimal random hepatitis
HET M #3 Thymus [MA:0000142]
HET F #8 Small intestine [MA:0000337]
HET F #7 Kidney [MA:0000368] 1 0 chronic chronic glomerulopathy
HET F #7 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Lung [MA:0000415]
HET M #6 Ear [MA:0000236]
HET M #5 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #4 Stomach [MA:0000353]
HET F #7 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #2 Thyroid
HET F #7 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Lung [MA:0000415]
HET F #8 Tongue [MA:0000347]
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #8 Brain [MA:0000168] 1 0 hydrocephalus
HET M #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #1 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Heart [MA:0000072] 1 0 chronic Cardiomyopathy with arteriosclerosis and endocardiosis
HET F #8 Tibia [MA:0001361]
HET F #8 Lymph node [MA:0000139]
HET M #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 1 0 Gastritis and epithelial hyalinosis at the limiting ridge
HET F #4 Heart [MA:0000072]
HET F #8 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Thymus [MA:0000142]
HET F #8 Sternum [MA:0001331] 1 1 intersternebrae/intervertebral degenerative disc disease
HET M #6 Lung [MA:0000415]
HET F #7 Liver [MA:0000358] 2 0 Centrilobular lipidosis and glycogenosis
HET F #7 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #8 Kidney [MA:0000368] 1 0 chronic chronic glomerulopathy
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #1 Eye [MA:0000261]
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #5 Thymus [MA:0000142]
HET M #2 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Large intestine [MA:0000333]
HET M #6 Large intestine [MA:0000333]
HET M #3 Spleen [MA:0000141]
HET F #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Lymph node [MA:0000139]
HET F #4 Thyroid
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #8 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #7 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #6 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #8 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Testis [MA:0000411] 2 0 seminiferous tubular degeneration with multinucleated giant cells, pachytene mitoses and decreased spermatogenesis
HET F #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #6 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #1 Heart [MA:0000072]
HET F #8 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #2 Lung [MA:0000415]
HET M #3 Skin [MA:0000151]
HET M #5 Tooth [MA:0000348]
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #5 Knee joint [MA:0000471] 2 1 chronic Osteoarthrosis with myxomatous cruciate ligament degeneration
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Spleen [MA:0000141]
HET F #7 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Pancreas [MA:0000120]
HET M #3 Esophagus [MA:0000352]
HET M #6 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Tongue [MA:0000347]
HET F #8 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #4 Brain [MA:0000168]
HET M #6 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #5 Lymph node [MA:0000139]
HET F #7 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #5 Eye [MA:0000261] 1 0 Superficial stromal cataract
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #6 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Esophagus [MA:0000352]
HET M #5 Spleen [MA:0000141]
HET F #8 Heart [MA:0000072] 1 0 cardiomyopathy
HET F #4 Kidney [MA:0000368] 1 0 mild focal chronic tubular degeneration with cystic ectasia
HET F #8 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Ear [MA:0000236]
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #6 Sternum [MA:0001331]
HET F #4 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Bone [MA:0001459]
HET M #3 Lymph node [MA:0000139]
HET F #1 Uterus [MA:0000389]
HET M #5 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #7 Ear [MA:0000236]
HET M #5 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #6 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Knee joint [MA:0000471] 3 1 Osteoarthrosis with myxomatous cruciate ligament degeneration, joint capsule fibrosis and multifocal chondroid metaplasia
HET M #3 Bone [MA:0001459]
HET F #7 Uterus [MA:0000389]
HET F #4 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #8 Bone [MA:0001459]
HET M #5 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Testis [MA:0000411]
HET F #8 Knee joint [MA:0000471] 1 1 Stifle osteoarthrosis with mild cruciate ligament degeneration
HET M #2 Brain [MA:0000168]
HET M #5 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #7 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #7 Bone marrow [MA:0000134] 1 0 focally extensive histiocytic sarcoma, in bone marrow of femur
HET F #7 Skin [MA:0000151]
HET M #5 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #8 Tooth [MA:0000348]
HET M #6 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #3 Thyroid
HET F #8 Thyroid
HET F #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #2 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Pancreas [MA:0000120]
HET F #8 Pancreas [MA:0000120]
HET M #6 Pancreas [MA:0000120]
HET M #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #2 Skin [MA:0000151]
HET M #5 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #5 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #2 Lymph node [MA:0000139]
HET F #7 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #3 Eye [MA:0000261] 1 0 Superficial stromal cataract
HET F #8 Eye [MA:0000261]
HET M #2 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #4 Thymus [MA:0000142]
HET M #5 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #5 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #6 Tooth [MA:0000348]
HET M #6 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #2 Sternum [MA:0001331]
HET M #6 Epididymis [MA:0000397]
HET F #8 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #7 Thyroid
HET F #4 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #7 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #4 Ear [MA:0000236]
HET M #5 Bone [MA:0001459]
HET F #7 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #8 Uterus [MA:0000389]
HET M #6 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #6 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Lung [MA:0000415]
HET F #7 Femur [MA:0001359]
HET F #7 Eye [MA:0000261] 1 0 Superficial stromal cataract
HET F #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #6 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Sternum [MA:0001331]
HET F #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #6 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Liver [MA:0000358]
HET M #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #5 Large intestine [MA:0000333]
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145]
HET M #2 Heart [MA:0000072]
HET M #2 Esophagus [MA:0000352]
HET F #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 2 0 chronic chronic glomerulopathy with tubular degeneration and casts
HET F #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #5 Liver [MA:0000358] 1 0 Centrilobular lipidosis and glycogenosis
HET F #7 Tibia [MA:0001361]
HET F #7 Thymus [MA:0000142]
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 1 1 Intersternabrae and intervertebral degenerative disc disease
HET M #6 Testis [MA:0000411]
HET F #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET F #8 Large intestine [MA:0000333]
HET M #6 Tongue [MA:0000347] 1 0 focal acute neutrophilic glossitis
HET F #4 Eye [MA:0000261]
HET M #3 Large intestine [MA:0000333]
HET M #5 Tibia [MA:0001361]
HET M #6 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #5 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #1 Thyroid
HET M #5 Pancreas [MA:0000120]
HET F #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #7 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #8 Spleen [MA:0000141]
HET F #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Knee joint [MA:0000471]
HET M #3 Femur [MA:0001359]
HET F #4 Bone [MA:0001459]
HET F #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #5 Testis [MA:0000411] 1 0 Atrophy
HET F #8 Ear [MA:0000236] 2 0 unilateral otitis media with fluid accumulation and mineralized concretions
HET M #3 Ear [MA:0000236]
HET F #4 Skin [MA:0000151]
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #7 Knee joint [MA:0000471] 2 1 chronic osteoarthrosis with cruciate ligament degeneration
HET M #5 Small intestine [MA:0000337]
HET F #7 Tooth [MA:0000348] 2 0 unilateral incisor dental dysplasia
HET M #5 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #2 Tongue [MA:0000347]
HET M #6 Eye [MA:0000261]
HET M #6 Gall bladder [MA:0000356]
HET F #8 Skin [MA:0000151]
HET F #7 Small intestine [MA:0000337]
HET M #2 Stomach [MA:0000353]
HET M #3 Epididymis [MA:0000397]
HET F #8 Ovary [MA:0000384]
HET F #7 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #8 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #4 Uterus [MA:0000389]
HET M #2 Epididymis [MA:0000397]
HET M #5 Thyroid
HET M #3 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #6 Lymph node [MA:0000139]
HET M #6 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #6 Trachea [MA:0000441]
HET M #6 Esophagus [MA:0000352]
HET M #5 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #6 Heart [MA:0000072]
HET M #5 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #3 Tibia [MA:0001361]
HET F #1 Brain [MA:0000168]
HET M #5 Epididymis [MA:0000397]
HET F #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #8 Thymus [MA:0000142]
HET F #1 Large intestine [MA:0000333]
HET M #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #1 Ear [MA:0000236]
HET M #6 Knee joint [MA:0000471]
HET M #5 Femur [MA:0001359]
HET M #2 Liver [MA:0000358]
HET M #5 Kidney [MA:0000368] 1 0 chronic glomerulopathy
HET F #7 Ovary [MA:0000384]
HET M #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #2 Femur [MA:0001359]
HET M #6 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #7 Large intestine [MA:0000333]
HET M #6 Bone [MA:0001459]
HET F #8 Lung [MA:0000415]
HET F #1 Small intestine [MA:0000337]
HET M #3 Brain [MA:0000168] 1 0 bilateral hydrocephalus
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET F #1 Ovary [MA:0000384]
HET M #6 Thyroid
HET F #8 Stomach [MA:0000353]
HET F #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #8 Trachea [MA:0000441]
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET M #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #8 Nasal cavity [MA:0000284]

Associated histopathology images

Ebf1
heterozygote
Sternum - MA term MA:0001331
Ebf1em1(IMPC)Mbp
experimental
Ebf1
heterozygote
Knee joint - MA term MA:0000471
Ebf1em1(IMPC)Mbp
experimental
Ebf1
heterozygote
Sternum - MA term MA:0001331
Ebf1em1(IMPC)Mbp
experimental

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter