Histopathology data for Cxcr4

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET F #3 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Pancreas [MA:0000120]
HET F #2 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Tongue [MA:0000347]
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Epididymis [MA:0000397]
HET F #3 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Kidney [MA:0000368]
HET F #3 Heart [MA:0000072]
HET M #1 Femur [MA:0001359]
HET F #3 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET M #4 Liver [MA:0000358]
HET M #1 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Large intestine [MA:0000333]
HET F #2 Tibia [MA:0001361]
HET F #2 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134]
HET F #3 Trachea [MA:0000441]
HET F #3 Nasal cavity [MA:0000284] 2 0 Nasal cavity: Moderate, acute luminal hemorrhage
HET F #2 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Thymus [MA:0000142]
HET M #1 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Lymph node [MA:0000139]
HET F #2 Small intestine [MA:0000337]
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Tibia [MA:0001361]
HET F #2 Brain [MA:0000168]
HET F #3 Eye [MA:0000261]
HET F #2 Ear [MA:0000236]
HET F #3 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Sternum [MA:0001331]
HET M #4 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410]
HET F #3 Thymus [MA:0000142]
HET M #4 Bone [MA:0001459]
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #4 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #1 Spleen [MA:0000141]
HET M #1 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Brain [MA:0000168]
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Small intestine [MA:0000337]
HET F #2 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 1 0 Uterus: Mild, stromal edema
HET F #2 Ovary [MA:0000384]
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404]
HET F #2 Esophagus [MA:0000352]
HET M #4 Testis [MA:0000411] 2 0 Testis, unilateral: Multifocal sperm stasis with associated tubular degeneration, necrosis and atrophy
HET M #1 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET M #1 Thyroid
HET F #2 Sternum [MA:0001331]
HET F #3 Pancreas [MA:0000120]
HET M #1 Gall bladder [MA:0000356] 1 0 Gallbladder: Mild, neutrophilic cholecystitis
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380]
HET M #1 Trachea [MA:0000441]
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 1 0 Spleen: Extramedullary hematopoiesis, mild increase
HET M #4 Large intestine [MA:0000333]
HET M #4 Tongue [MA:0000347]
HET M #1 Lymph node [MA:0000139]
HET M #1 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #1 Bone [MA:0001459]
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #2 Stomach [MA:0000353]
HET F #3 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #3 Liver [MA:0000358] 1 0 Liver: Mild, focal, neutrophilic and mononuclear, cellular infiltrate
HET F #2 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Tibia [MA:0001361]
HET M #1 Eye [MA:0000261]
HET M #4 Stomach [MA:0000353]
HET M #4 Lung [MA:0000415]
HET F #2 Tongue [MA:0000347]
HET F #3 Brown adipose tissue [MA:0000057] 2 0 Brown adipose tissue: Moderate, locally extensive, mononuclear steatitis
HET M #1 Esophagus [MA:0000352]
HET F #2 Lung [MA:0000415]
HET M #1 Tooth [MA:0000348]
HET M #1 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #1 Testis [MA:0000411]
HET M #4 Heart [MA:0000072]
HET M #4 Ear [MA:0000236]
HET M #4 Kidney [MA:0000368]
HET M #4 Spleen [MA:0000141]
HET F #3 Trigeminal V ganglion [MA:0001080]
HET F #3 Gall bladder [MA:0000356] 2 0 Gallbladder: Moderate, neutrophilic cholecystitis
HET F #2 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Thyroid
HET M #1 Brain [MA:0000168]
HET F #2 Kidney [MA:0000368]
HET M #1 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #1 Knee joint [MA:0000471]
HET M #4 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Prostate gland [MA:0000404]
HET M #4 Eye [MA:0000261]
HET F #3 Lymph node [MA:0000139] 2 0 Lymph node, mesenteric: Mild to moderate, follicular lymphoid hyperplasia
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216]
HET M #1 Lung [MA:0000415]
HET M #4 Femur [MA:0001359]
HET M #1 Stomach [MA:0000353]
HET F #2 Trachea [MA:0000441]
HET M #1 Liver [MA:0000358]
HET F #2 Nasal cavity [MA:0000284]
HET F #3 Sciatic nerve [MA:0001172]
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Thyroid
HET F #3 Esophagus [MA:0000352]
HET F #3 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #1 Heart [MA:0000072]
HET F #3 Ovary [MA:0000384]
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356]
HET M #4 Nasal cavity [MA:0000284]
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148]
HET F #2 Thyroid
HET M #1 Bone marrow [MA:0000134]
HET M #4 Knee joint [MA:0000471]
HET F #3 Urinary bladder [MA:0000380]
HET F #3 Adrenal gland [MA:0000116]
HET F #3 Salivary gland [MA:0000346]
HET M #4 Skin [MA:0000151]
HET M #4 Tooth [MA:0000348]
HET F #3 Bone [MA:0001459]
HET M #1 Brown adipose tissue [MA:0000057]
HET M #4 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Femur [MA:0001359]
HET F #2 Pancreas [MA:0000120]
HET F #3 Uterus [MA:0000389]
HET M #4 Epididymis [MA:0000397]
HET M #4 Sternum [MA:0001331]
HET F #2 Skin [MA:0000151]
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145]
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216]
HET F #2 Thymus [MA:0000142]
HET F #2 Eye [MA:0000261]
HET M #1 Ear [MA:0000236]
HET M #1 Large intestine [MA:0000333]
HET F #3 Small intestine [MA:0000337]
HET F #3 Brain [MA:0000168]

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter