Histopathology data for Cplane1

Score Definitions

Severity Score:

  • 0 = Normal,
  • 1 = Mild (observation barely perceptible and not believed to have clinical significance),
  • 2 = Moderate (observation visible but involves minor proportion of tissue and clinical consequences of observation are most likely subclinical),
  • 3 = Marked (observation clearly visible involves a significant proportion of tissue and is likely to have some clinical manifestations generally expected to be minor),
  • 4 = Severe (observation clearly visible involves a major proportion of tissue and clinical manifestations are likely associated with significant tissue dysfunction or damage)

Significance Score:

  • 0 = Not significant: Interpreted by the histopathologist to be a finding attributable to background strain (e.g. low-incidence hydrocephalus, microphthalmia) or incidental to mutant phenotype (e.g. hair-induced glossitis, focal hyperplasia, mild mononuclear cell infiltrate).
  • 1 = Significant: Interpreted by the histopathologist as a finding not attributable to background strain and not incidental to mutant phenotype.


Zyg Sex Mouse Tissue MPATH Process Term Severity Score Significance Score MPATH Diagnostic PATO Descriptor Free Text Images
HET M #3 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET M #4 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #1 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #1 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET M #3 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET F #2 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #4 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #2 Lung [MA:0000415] 0 0
HET F #2 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET F #2 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET M #3 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #4 Testis [MA:0000411] 0 0
HET F #2 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #2 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #1 Liver [MA:0000358] 0 0
HET F #1 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Heart [MA:0000072] 0 0
HET M #3 Brain [MA:0000168] 0 0
HET F #1 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #3 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #3 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET M #3 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET M #4 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #2 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #1 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #3 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET M #4 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET M #3 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #2 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #3 Testis [MA:0000411] 0 0
HET M #4 Seminal vesicle [MA:0000410] 0 0
HET F #1 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET F #1 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #2 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #1 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #2 Urinary bladder [MA:0000380] 0 0
HET F #1 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #2 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #4 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET F #1 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET F #2 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #2 Ovary [MA:0000384] 0 0
HET F #2 Salivary gland [MA:0000346] 0 0
HET F #1 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #3 Ovary [MA:0000384] Not applicable
HET F #2 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #2 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET M #3 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #4 Large intestine [MA:0000333] 0 0
HET F #2 Seminal vesicle [MA:0000410] Not applicable
HET F #1 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET F #2 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #1 Prostate gland [MA:0000404] Not applicable
HET F #1 Testis [MA:0000411] Not applicable
HET F #2 Uterus [MA:0000389] 0 0
HET M #4 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #1 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Thyroid 0 0
HET M #4 Bone marrow [MA:0000134] 0 0
HET F #1 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #3 Small intestine [MA:0000337] 0 0
HET M #4 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #4 Tongue [MA:0000347] 0 0
HET M #3 Mammary gland [MA:0000145] Not applicable
HET M #3 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Heart [MA:0000072] 0 0
HET F #1 Sciatic nerve [MA:0001172] 0 0
HET M #3 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET F #1 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #4 Uterus [MA:0000389] Not applicable
HET M #4 Esophagus [MA:0000352] 0 0
HET F #1 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET F #1 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET M #4 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET M #4 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Lymph node [MA:0000139] 0 0
HET F #2 Liver [MA:0000358] 0 0
HET M #4 Prostate gland [MA:0000404] 0 0
HET F #1 Heart [MA:0000072] 2 0 localized chronic Right ventricular epicardial fibrosis, focal
HET M #4 Brain [MA:0000168] 0 0
HET M #4 Optic II nerve [MA:0001097] 0 0
HET M #4 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Adrenal gland [MA:0000116] 0 0
HET M #4 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET F #2 Trachea [MA:0000441] 0 0
HET F #2 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Stomach [MA:0000353] 0 0
HET M #4 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET M #3 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #2 Eye [MA:0000261] 0 0
HET M #3 Kidney [MA:0000368] 0 0
HET F #2 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Thyroid 0 0
HET F #2 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET M #4 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET F #1 Lung [MA:0000415] 0 0
HET M #3 Spleen [MA:0000141] 0 0
HET F #1 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #2 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #4 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #2 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET M #3 Thyroid 0 0
HET F #2 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #3 Femur [MA:0001359] 0 0
HET F #2 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0
HET F #1 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET M #3 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET F #1 Skin [MA:0000151] 0 0
HET F #1 Mammary gland [MA:0000145] 0 0
HET F #1 Thymus [MA:0000142] 0 0
HET M #4 Femur [MA:0001359] 0 0
HET M #4 Eye [MA:0000261] 1 0 localized chronic focal retinal dysplasia.
HET M #4 Pancreas [MA:0000120] 0 0
HET M #3 Spinal cord [MA:0000216] 0 0
HET F #1 Sternum [MA:0001331] 3 0 chronic localized Sternal segment dislocation
HET F #2 Epididymis [MA:0000397] Not applicable
HET F #2 Sternum [MA:0001331] 0 0
HET M #3 Epididymis [MA:0000397] 0 0
HET M #3 Skin [MA:0000151] 0 0
HET M #3 Eye [MA:0000261] 1 0 multi-localised chronic multifocal retinal dysplasia.
HET M #4 Thyroid 0 0
HET M #4 Gall bladder [MA:0000356] 0 0
HET M #3 Skeletal muscle [MA:0003148] 0 0

Associated histopathology images

The IMPC Newsletter

Get highlights of the most important data releases, news and events, delivered straight to your email inbox

Subscribe to newsletter